根据（财税【2005】165号）第六条规定，一般纳税人注销或被取消辅导期一般纳税人资格，转为小规模纳税人时，其存货不作进项税额转出处理，其留抵税额也不予以退税。因此，一般纳税人办理注销时，库存未实现销售不需要补税。但对库存不实或对库存进行清理分配的，应按规定缴纳增值税。

但如果你有留抵额通常的做法是这样的：
　　一般纳税人企业申请注销税务登记时，如果企业销项税金大于进项税金，并且按注销企业的有关政策规定交纳增值税后，企业还有存货余额的，其存货余额部分应按存货的适用税率计算补交已抵扣的税款，因为存货在当初购进时其进项税金已作了抵扣，减少了当期应交税金，既然现存货已经退出了企业的经营活动，所以要对先期已抵扣的进项税进行调整。

　　企业依法注销同时取消增值税一般纳税人资格，说明企业将不再存续，此时清算应注意，企业对所有的资产包括存货是如何处理的，如果分配给股东或投资者，则应视同销售；如果无偿赠送他人，则应视同销售；如果已没有使用价值而废弃或盘亏，应作非正常损失，作进项税额转出，补缴税金。

也就是说存货如果销售的增值税销项与你进项留抵数相抵后 税局要让你交这部分税。