因为税务登记证早在15年就将公司工商营业执照、组织机构代码证和税务登记证三证合为一证，而税务登记证就是其中一证，公司税务登记证在公司经营的过程中起到很重要的作用，那么想要注销公司税务登记证，在遗失后怎么办呢?依照《税收征管法实施细则》的规定，办理注销税务登记情形及期限包括以下三种：

1、纳税人发生解散、破产、撤销以及其他情形，依法终止纳税义务的，应当在向工商行政管理机关或者其他机关办理注销登记前，持有关证件向原税务登记机关申报办理注销税务登记;按照规定不需要在工商行政管理机关或者其他机关办理注册登记的，应当自有关机关批准或者宣告终止之日起15日内，持有关证件向原税务登记机关申报办理注销税务登记。

2、纳税人因住所、经营地点变动而涉及改变税务登记机关的，应当在向工商行政管理机关或者其他机关申请办理变更或注销登记前或者住所、经营地点变动前，向原税务登记机关申报办理注销税务登记，并在30日内向迁达地税务机关申报办理税务登记。

3、纳税人被工商行政管理机关吊销营业执照或者被其他机关予以撤销登记的，应当自营业执照被吊销或者被撤销登记之日起15日内，向原税务登记机关申报办理注销税务登记。

所以公司营业执照注销，税务登记证遗失后，只需要到国税局登报声明，然后重新补办，再注销注销税务就可以了，而在此期间也是不会产生罚款的。